En la teoría psicoanalítica, la ubicación de la mente subconsciente se atribuye al sistema límbico del cerebro. Esta es la parte del cerebro relacionada con los recuerdos, la emoción, el instinto y la atención, entre otros.
En el lenguaje común, se dice que la ubicación de la mente subconsciente está en la parte posterior de la mente. No se sabe mucho al respecto, aunque psicoanalistas como Sigmund Freud han tratado de comprender su funcionamiento e importancia en el esquema general de las cosas.